lenovoboy

<header>
  <div class="container">
    <a class="logo">
      <img src="">
    </a>
    <button class="close"/>
    <nav>
      <ul></ul>
    </nav>
  </div>
</header>

сбрасываем ширину у всех элементов шапки, тем самым растягиваем на весь экран
.container

display: flex; flex-flow: row wrap; justify-content: space-between;

nav
flex: 100%; text-align: center;

плюс\минус напильником под ваш случай

Добавить ещё один враппер внутрь центровщика для контента, а сам центровщик - растягивать всегда на всю ширину. Таким образом, разделив одну область на 2-е разных с независимым поведением.