lagudal

нашел, слепой - там по дефолту в темплейте addtocart.phtml вызывается сразу после add to cart button -

</button>
            <?= $block->getChildHtml('', true) ?>

а я его еще раз сверху вызываю.
Убрал нижний вызов, все как надо заработало

Вопрос в google на англ. - существует большая вероятность, что похожие вопросы и ответы там есть (если правильно сформулировать). Если так, то, как правило, ссылки ведут на 3 ресурса. Там и спрашивать лучше всего.
1. https://magento.stackexchange.com/
аналог https://stackoverflow.com/ -
2 Собственно сам https://stackoverflow.com/, в нм тоже есть вопросы по magento, но ответов мало в последнее время.
3. Github - если вопрос связан с багом основного функционала magento, то на оф. гит М2 - https://github.com/magento/magento2/ - создаем новый https://github.com/magento/magento2/issues и ждем.

Если кому то интересно, вот ответили на magento exchange
Код рабочий, единственное, чтобы включить кнопки "в корзину" вверху в свитче установить $showCart = true; для необходимых кейсов. Ну об этом там в последнем комментарии написал.

В принципе решено, вот здесь скорректированный код.
Все отлично работает, единственное, они там добавили анимацию с animate.css- справа появляется и туда же уходит.
В тех случаях, когда сообщение добавляется после перезагрузки страницы, например, добавить для сравнения, сообщение появляется справа, уходит направо, потом еще раз то же сообщение в том же порядке. Т.е. дублируется.
Попробовал заменить на другую анимацию, например, fadeOut, - такой же эффект, дублируются...
Без анимации все нормально. Хотя плавное скрытие, например, opacity анимация не повредила бы..