Я вообще в свое время отказался от идеи использования IDE. Причиной стала Java, и как следствие, низкая скорость работы IDE в сравнении с Sublime Text, на который я и перешел в итоге. Использовал я ранее кстати PHPStorm, он тогда еще был для меня бесплатным по какой-то программе.
Из минусов - потеря многих возможностей относительно автоматизации, и хранения всего возможного в одной коробке. Решается путем применения отдельных решений для конкретных задач. Нужно хорошо постараться, чтобы наладить всю требуемую инфраструктуру за пределами IDE.
Из плюсов - Sublime Text имеет много возможностей, и расширений. Поэтому большая часть того, чего вам будет не хватать в отсутствие IDE, может быть перекрыта расширениями для Sublime Text и по сути из него можно сделать тот же IDE, только с некоторыми ограничениями относительно привычных разработчикам инструментов. Главным плюсом конечно является высокая скорость работы Sublime Text. Я сравнивал с подобным ему редактором Atom, и тот ощутимо, в разы уступает в скорости загрузки и отображения данных. Также к плюсам стоит отнести то, что лицензия на Sublime Text покупается единожды и бессрочно.
Надо учесть, что моей основной ОС для работы является Windows последних версий, и программы написанные на Java у меня почему-то всегда вызывали плохое впечатление в сравнении с более нативными вариантами относительно их производительности. Это как с MS Office и LibreOffice. Первая конечно быстрее и лучше работает, зато вторая бесплатная.