PCIe x16 2.0 или 3.0 просто будут работать немного медленнее чем могли бы на более новой материнке. Работать будет, когда материнку поменяете заработает чуть быстрее. Тем более карта не очень мощная, не думаю что 1.0 сильно обрежет производительность.