Посмотрите другие программы переноса, в том числе от производителей SSD. У Самсунгов что-то своё есть, может и у других. Не могу точно вспомнить, но кажется я в какой-то программе переноса видел возможность выбора объектов для переноса (не самсунговской ли как раз?).
А то может переустановить всё с нуля? За то время, что программа ищется, уже и переустановилось бы всё. :)