Я думаю вам будет проще организовать просто два проекта. Один на Yii2, где будет просто REST Api и возможн админка, и другой - приложение на angular. Два разных приложения, которые ничего особо не знают друг о друге, их связывает лишь HTTP и REST.
Вообще плюс подобных подходов в том, что разные методы можно делать на разных фреймворках, языках программирования, разносить на разные сервера... короче кучи всего в угоду производительности делать. Да и так проще организовать проект будет вам.