Иван Карманов

Судя по ошибке, дело не в Python-скрипте, а в самой программе, которую пытаешься запустить. Если ту же самую команду запустить через консоль, ошибка сохраняется?

Возвращай из функции code_morse нужную тебе переменную и сохраняй где надо в момент вызова.

...
    m_text = '/'.join(m_letters)
    return m_text

Тогда в переменной translate у тебя будет записано значение этой переменной

Если тебе надо, чтобы JS изменил сам документ, создал какие-то теги и т.д., то можешь использовать Selenium. Запустишь через него свой код, подождёшь пока он всё сделает и можешь доставать из него что тебе надо.

Перед публикацией вопроса советовал бы повнимательнее проверять свой код.
Проблема банальная - условия с использованием lower() не везде написаны корректно
Конкретно вот это:

if the_aim.lower() == "похудение":
    the_man_kal = the_man_kal - 500
    the_woman_kal = the_woman_kal - 500
elif the_aim == "Увеличение мышечной массы":
    the_man_kal = the_man_kal + 1300
    the_woman_kal = the_woman_kal + 1300
elif the_aim == "Поддержание веса":
    the_man_kal = the_man_kal
    the_woman_kal = the_woman_kal

Следует заменить на это:

if the_aim.lower() == "похудение":
    the_man_kal -= 500
    the_woman_kal -= 500
elif the_aim.lower() == "увеличение мышечной массы":
    the_man_kal += 1300
    the_woman_kal += 1300

А вот это:

if the_sex.lower() == "Мужской":
    print("Количество калорий для", the_aim, ": ", the_man_kal, "калл")
elif the_sex == "Женский":
    print("Количество калорий для", the_aim,
          ": ", the_woman_kal, "калл")

На это:

if the_sex.lower() == "мужской":
    print("Количество калорий для", the_aim, ": ", the_man_kal, "калл")
elif the_sex.lower() == "женский":
    print("Количество калорий для", the_aim, ": ", the_woman_kal, "калл")

Сейчас тоже только начал изучат Python по второй книге, все интересно, разжевано, практики достаточно главное. Ещё очень интересная книга "Автоматизацияя рутинных задач с помощь Python". там хоть теории немного, зато показано что можно с помощью питона творить