Очевидно, $_FILES['upfile'] не установлен. Может быть, Вы подключаете этот скрипт не только когда происходит submit, а вообще? Установлен ли атрибут формы enctype="multipart/form-data"? Установлен ли атрибут method в POST (а не GET)? Присутствует ли <input type="hidden" name="MAX_FILE_SIZE" value="104857600" /> сразу после <form>?
