Си можно начать изучать с книги "Язык программирования Си" Кернигана и Ритчи. Или с "Head First C" (я начинал с неё). Потом можно почитать про новые фичи стандарта c11.
Если вы хотите низкоуровневым программированием заниматься, то для начала нужно прочитать "Архитектура Компьютера" Таненбаума. Ещё есть очень хорошая книга "Цифровая схемотехника и архитектура компьютера" от Сары и Дэвида Харрис.
Потом читать спецификации на железки, под которые вы хотите писать код.