Ilya

К сожалению - никак. You can only have one output path., но можно использовать несколько конфигов и экспортировать массив с этими конфигами:

// webpack.config.js

const { join } = require('path');

const appConfig = {
    entry: './src/app.js',
    output: {
        filename: '[name].js',
        path: join(__dirname, 'dist/app')
    }
};

const searchConfig = {
    entry: './src/search.js',
    output: {
        filename: '[name].js',
        path: join(__dirname, 'dist/search')
    }
};

const common = {
    context: __dirname,

    module: {
        rules: [...]
    }
};

module.exports = [{
    ...common,
    ...appConfig
}, {
    ...common,
    ...searchConfig
}];

Update к ответу: если ставить NVM после того как стоит node.js - у вас, возможно, не будет желаемого результата.
Поэтому: удалите полностью node.js со всеми модулями (включая глобальные) - https://www.google.ru/webhp?sourceid=chrome-instan..., затем установите NVM и установите node.js нужной версии через него.

User authorization failed: no access_token passed.

Токен не передаете в запросе