Интересно, почему никто не прошелся по Bacula. Слегка мудреный конфиг, но если все заточить под свои нужды, вещь весьма достойная. Так же легковесный rdiff-backup, ну и правильно пишут выше сам rsync. При наличии желания, времени можно написать на его основе вагон и тележку скриптов по резервированию системы.
