Чтобы не изменять структуру верстки можно средствами js и jquery
CSS
html {
position: relative;
min-height: 100%;
}
footer {
display:none;
position: absolute;
left: 0;
bottom: 0;
height: auto;
width: 100%;
}
JS
function footerAlign() {
$('footer').css('display', 'block');
$('footer').css('height', 'auto');
var footerHeight = $('footer').outerHeight();
$('body').css('padding-bottom', footerHeight);
$('footer').css('height', footerHeight);
}
$(document).ready(function(){
footerAlign();
});
$( window ).resize(function() {
footerAlign();
});