PEP8 вот тут написаны рекомендации и про функии и про переменные и про классы, про то что за чем располагать, про количество символов в строке, про отступы..
уточните, что именно Вам нужно хранить? быть может стоит поподробнее описать логику работы бота?
а так, думаю в базе, для простоты можно начать с sqlite, библиотеки для работы с ней в python есть
