Сайт или веб-приложение? Если вы хотите создать какое-то веб-приложение, то вот совет: не беритесь за сложные вещи, пока только учитесь. Диплом скорее всего и читать толком никто не будет, сосредоточьтесь на знаниях, которые хотите получить. Если уже хорошо знаете JavaSE, то можете взяться за JEE или Spring и сделав с их помощью что-то простое, to-do list или какую-нибудь личную библиотеку.