Антон Папин

Не очень понял конструкцию с whExp, вот мой вариант:

string[] searchArray = {"WORD1","WORD2"};
var vars = db.vars.Where(v =>  searchArray.Contains(v.word)).Select(v => v.id);

var xrefs = dr.xref.Where(x => vars.Contains(x.wordid)).GroupBy(x => x.itemid)
    .Select(g => new
    {
        ItemId = g.Key,
        Score = g.Sum(s => s.weight),
        CountItemId = g.Count()
    })
    .OrderByDescending(r => r.CountItemId)
    .ThenByDescending(r => r.Score)
    .Take(20)
    .Select(o => o.ItemId);

var items = db.Items.Where(i => xrefs.Contains(i.id));

Лучше всего - используйте фреймворк для работы с данными. Entity Framework или NHibernate, на выбор.

Появляется и пропадает - ненормальное поведение. Цепляйтесь дебаггером и пошагово смотрите, в чём проблема.