illuzor

а если я сейчас переключусь в branch-1 - она что, будет в том виде, в каком я ее оставил? без новых изменений, привнесенных после нее в master?

Верно.

а как же тогда быть? а если мне, например, в этой branch-1 как раз нужны те новые фичи которые появились в master?

Либо сделать merge master в branch-1, либо сразу пулить из master в branch-1. Также можно сделать rebase или скопировать коммиты через cherry pick

ну, т.е. понимаете вопрос, да?

Понимаем

Если файлы уже добавлены в индекс, надо удалить через git rm

Объединять нельзя, но можно создать новый репозиторий, а имеющиеся подключить к нему в виде сабмодулей.
https://git-scm.com/book/en/v2/Git-Tools-Submodules

Нужно использовать reset, а не revert

Нужно файл id_rsa положить в папку C:\Users\user\.ssh
Больше ничего делать не надо. Сам подцепится.

Почитайте про .gitignore

Если сложно работать в консоли, можно использовать официальное приложение гитхаба. Но основы всё равно стоит знать.

git pull