Артём

Попробуй так:
driver.findElement(By.id(element_id)).getLocation()
driver.mouseMove(coordinates.getX(),coordinates.getY())

Если попап появляется выше\ниже\сбоку, добавь еще одно перемещение мыши. Далее просто клик.

Есть несколько веток разработки в ГИТе и разработчики разворачивают необходимые для тестирования ветки в соответствии с agile.

то чем занять разработчиков?

Естественно, задачами следующего спринта и задачами, которые перенесены из этого спринта в следующий.
Ну и исправлением багов, естественно.

Зависит от знания софта+ЯП. Могу только подсказать стандартные направления на собеседованиях всех QA.
1) HTTP-протокол
2) Браузеры, консоль браузера
3) SQL(запросы)
4) Тест api(софт)
5) Знания ЯП, ООП
6) Теория тестирования(регресс, смоук, различие по ящикам и т.д.)
7) Тестирование МП(софт)
8) Форматы json/xml

Могу предложить решение Selenium+Python.
1) С помощью вебдрайвера прогоняем фронт.
2) Им же ловим отправляемый в api запрос, сравниваем с "правильным" запросом
3) Не описан бекенд, не могу дальше посоветовать.