Нельзя сравнивать JMeter с Yandex Tank.
Yandex.Tank яляеться системой менеджмента тестов, и он может работать с тем же JMeter.
Так же к нему можно подключить и другие генераторы нагрузки:
-Phantom
-BGF
-Pandora
- и все тот же JMeter
все зависит от стощей перед Вами задачей