Что обозначает вот этот объект?

геттеры, сеттеры в объектах.

Повторять один и тот же запрос на сервер, пока значение ключа в ответе не поменяется?

не вижу, где здесь большие вложенные условия.
Есть процедура запроса, есть процедура приёма ответа, в приёмнике надо одно условие на этот ключ и вызов запроса.

Как вызвать функцию с разным числом аргументов по условию?

деструктуризация, кажется.

function destr( { key1, key2, hello } ) {/*...*/}

Как сделать вот такой блок?

круглые границы у псевдо-элемента, который трансформируется translate-skew-rotate, коэффициенты подбирать до умопомрачения.

Как лучше генерировать элементы на странице?

Можно ещё сымитировать текстовую консоль - пишешь команды, получаешь портянки текста без лишнего хтмл.

Как установить таймер на кнопку?

Если нодежс не будет вылетать, то можно через простой setTimeout выставлять флаг возможности нажатия на кнопку, так сама нода будет "помнить" о кнопке. Если же предполагается, что нода будет падать и перезапускаться, то нужно внешнее хранилище временной метки для флага, для такой простой задачи можно просто хэш-таблицу сделать с резервированием на диск в виде json-файла.
Если такая кнопка общая для всех, хватит одного таймера или метки, или для каждого клиента своя.

Возможно ли и как правильно анимировать path в svg с плавным эффектом качания?

В видео линии похожи на образующие криволинейной поверхности, причём из синусов, по времени меняется фаза и амплитуда каждой образующей синусоиды, к тому же параметры соседних образующих также расположены в синусной зависимости. На первый взгляд. В примере поста синусные линии ещё и завёрнуты вокруг какого-то центра.
Потом вращение отображаемой поверхности в 3-х измерениях по математическим правилам, которые можно найти или высчитать самому в самом простом варианте. Если тяжело, то можно вращать с помощью css.
Расчёт на js будет долгим, но не требуется считать постоянно, можно заполнить некую покадровую таблицу — здесь оптимизация получится достаточной в разумных пределах.

Почему пропадает плюс из $_COOKIE?

Строковой заменой или специальными функциями обработки url.

Почему пропадает плюс из $_COOKIE?

Через запись его в кодировке для url, типа "%25".

Какие ЯП надо знать ИП?

Нужно знать стандарты, протоколы, архитектуру ЭВМ по железу и софту. Языки пусть знают программисты, от безопасника им нужно получать руководство как делать и как не делать.
Есть специальность на пересечении программирования и безопасности - аудит исходного кода программ, но там нужно уметь читать любой популярный язык, и не забывать про стандарты-протоколы-архитектуру.

Настройка шкалы от Material Design Lite?

Ну, например, для формирования такой шкалы.
Картинки из Гугла могут показать, как распределяются числа на логарифмической прямой. Шкала - прямая. Сумма в евро - число. Логарифмы - возведение в степень - обратные преобразования.

Как оптимизировать загрузку фотографий на php(Laravel)?

Грузить по одной фотке за сеанс/запрос.

Как создать html "элемент" из сложного объекта?

Гуглить "шаблонизатор". Можно найти целую библиотеку, а можно и функцию - как повезет. В конце концов, можно написать самому, при хорошем формате записи получится обойтись функцией строковой замены на регулярных выражениях.

Как создать html "элемент" из сложного объекта?

"Шаблонизаторы" могут из подобного собирать хтмл, но внутри именно createElement или innerHTML.

Как преобразовать JSON в литерал объект JS?

Регулярным выражением можно.

Почему не срабатывает данный скрипт?

appendChild

Формат файла описывающий действия?

В целом, да. "Новизна" сценарного поведения бота может быть обусловлена случайностью выбора по каким-нибудь словам или же сервер как-то более совершенным алгоритмами будет поставлять всё новые и новые процедуры с учётом получаемых фраз. Хотя, из того, что есть какой-то начальный сценарий, особо серьезного изменения поведения предполагается не вносить, ибо сценарий сам суть программа, различия каждого нового "дубля" только в деталях.

Формат файла описывающий действия?

На Js можно сделать хэш из именованных процедур и общим выборщиком, который по словам-параметрам будет дергать нужные процедуры. А при надобности этот хэш будет пополняться и изменяться, через API по принуждению от сервера или даже самостоятельно из своих же процедур.

Как исключить значения из массива?

как-то так, _{я больше по js}

array_map( function( $i ) {
  return $ar1[ $i ];
}, $ar2 );

Как записать новый объект в объект?

Я на хабре читал. Среди ответов по тегу javascript есть много подобного.

Ну тут опять одинаковый IMEI у записей, в результате останется одна запись.