если проект маленький, типа небольшого апи сделать, или трех-четырех страничник - тогда однозначно Flask. если планируется куча всего, подмодули и прочее - то однозначно Django.
просто переходите на Django. меньше головной боли получите
a = 1
def test():
print a
a = 2
test()
a = 1
def test():
print 'ok' # -> 'ok'
print locals() # -> {}
print a # ERROR
a = 2