globotron

А можно полюбопытствовать — зачем вам это нужно?

PHP tokenizer использует свои внутренние структуры интерпретатора PHP и работает быстро, т.к. написан на C. А вот чисто питонья библиотека будет работать намного медленнее. Библиотека для питона, написанная на С, для разбора PHP — мне кажется, что будет очень сложно найти что-то похожее.

Почему бы не поднять fcgi с php, не делать разбор там и отдавать результаты питону в виде JSON?

1. У вас ведь убунта, зачем вам LAMP?
sudo apt-get install apache2-mpm-prefork libapache2-mod-php5 mysql-server
и всё пропишется само, будет работать и обновляться вместе с ОС

2. Если вам важен именно LAMP с самописными скриптами — можете добавить скрипты автозапуска в /etc/init.d
В той же папке скопировать «sudo cp skeleton apache2», править apache2 для запуска и останова апача. То же самое для mysql. Потом «update-rc.d apache2 defaults» для запуска сервиса при загрузке. Но этот путь не для вас.