Как в браузере подгружать на страницу 3д модели не с сервера, а из своей папки? Или как подгружать много 3д моделей через браузер?

Александр, что именно?

Как в браузере подгружать на страницу 3д модели не с сервера, а из своей папки? Или как подгружать много 3д моделей через браузер?

Это вообще без Unity можно реализовать на базе three.js например. Unity вроде вообще не обсуждалось здесь. javascript интерфейс нужен для взаимодействия с# и html страницы на котором будет отрисовываться сам WEBGL.