Для себя я решил бы задачу не посредственно на Esxi, хоть часть ДЦ и на Hyper-V :) (привет холиварам).
Посмотрел бы по текущей пиковой нагрузке и если не превышает которая и 20%, конвертнул бы ее в реальном режиме на внешний бокс в этом сервере, и после когда предупредил пользователей остановил бы сервис 1с кластера и в MSSQL забэкапел бы базу.
Повесил ESXi как и планируете, перенес с бы с бокса машинку, при атачил бы, развернул свежую базу и дал бы работу пользователям. А там остальные пляски с бубнами которые вам нужны.
По хорошему знать что и как у вас с винтами? Оставляем стандартно, а вот базы (дата\девайс базы.) на другое раздел.
Не ясно как подключаются к 1с кластеру? РДП или клиенты на раб. станциях.
Тобишь в моем бы случае, в самом простом варианте это было бы RAID1 (2 винта) для ОС и для Raid 5 (3 винта) для остального.
А Гарант файловый ему вообще до "облако" что творится :)