Георг Гаал

Такая задача идеально решается при помощи s3 или любого объектного хранилища. Оно имеет в себе функции ограничения доступа, удаления старых файлов, и, самое главное, - не нужно самому эти отчёты прокачивать через свой хттп сервер - можно давать ссылку напрямую на хранилище прямо на конкретный отчет.

Для хранения каких-либо метаданных приложения отлично подходит универсальная СУБД PostgreSQL

Ещё вариант:
сделать минимальный CD-процесс.
Как это выглядит?
1. Развернуть репозиторий на GitLab
2. Установить gitlab-runner на целевой машине
3. И подключить к репозиторию
4. В репозитории создать файл .gitlab-ci.yml и в нем описать шаги по обновлению кода.

Если сервер доступен извне, то можно п.2 пропустить и в скрипте, который описывается в шаге 4, попросту подключиться по ssh к серверу и проделать все необходимые действия.

Ну, либо, как советуют выше, использовать watcher'ы, которые будут следить за кодом в репозитории и при обновлении обновлять код автоматически на целевой машине