Если решение сменить DE принято, то переходить однозначно нужно.
Unity вполне можно считать завершённой оболочкой со своими индивидуальными особенностями. Например, мне очень нравится стремление Canonical экономить место, объединяя верхнюю панель с заголовком развёрнутого окна. Возможно, я плохо искал, но в других оболочках я такого решения не встречал.
Да, у Unity есть глюки. Да, она потребляет памяти больше, чем многие оппоненты. Да, многие решения непривычны, а что-то вообще может вообще раздражать. Но в целом, повторюсь, это готовый к ежедневному использованию DE. Единственный баг, который меня на данный момент (14.04) раздражает - это переключение раскладки клавиатуры. Он так с 12.10 и не был вылечен, приходится пользоваться патчем (то ли патч кривой, то ли сама система себя ведёт именно так, но сейчас при переключении раскладки некоторые поля ввода теряют фокус, приходится тянуться к мыши).
Если уж дальше рассуждать об альтернативах Mate, то можете рассмотреть и Gnome последних версий - ребята там не теряют времени. Я бы сам рад пересесть на него, но эта "совмещающаяся панель"... к ней быстро привыкаешь, и уже в других оболочках становится жаль занятое впустую пространство по вертикали.