Всем привет, извиняюсь, что не сразу отписался)
Не могу сказать, что исправило ситуацию, но под вечер скорость копирования значительно увеличилась, файлы переносятся и скачиваются просто моментально)
Сбрасывал настройки биоса, запускал оптимизацию и дефрагментацию через системную утилиту сервера, сносил настройки сети через командную строку, после всех действий файлы стали перебрасываться почти моментально)
Спасибо всем за помощь!