Если ваша задача - организация, то почему бы не посмотреть в сторону уже готовых СЗИ (средств защиты информации), Есть много наработок как на 152-ФЗ, так и по защите гос. тайны. Там предусмотрено многое, от доступа к ПК и его разблокировки путем прикладывания карт, до шифрования данных внутри контейнеров.
Если же Вам надо просто реализовать хранение, я использую Boxcryptor для предоставления данных нескольким людям.