Стандартными средствами МойСклад не делали интеграцию (через интернет-магазин в тарифе), так как много чего нельзя передавать в ней, обращались к компании
Edobro за интеграцией, по итогу сделали через API 1.2, сложностей не было да и по времени не сильно долго вышло, работает без нареканий