Как верстаются такие линии???

Они должны быть адаптивными или фиксированными?

Как сделать подтверждение закрытия вкладки?

Jack Brown, не уверен, но может пойдёт alert?

Как привязать линии от одного блока к другому?

Jack Brown, да, именно автоматизировать.
Потому что моя сетка из блоков организованна по принципу css grid.

Не обязательно прилагать код, достаточно обьяснить концепцию.

Как сделать простое web приложение для психологического теста?

Comatu, тебе посоветовать учебные пособия или что-то иное?
Расписывать весь принцип здесь — не вариант.

Какую книгу купить для изучения mySQL + php на углубленном уровне?

JackShcherbakov, так прочитай описание книги сначала, прежде чем кидаться тапками)