Если вас, как я понял, интересует, нужен ли серверу другой сертификат для подключения по другому порту через другой протокол, то ответ - не нужен: сертификат выдается для использования указанного в нем имени DNS хоста(одного или нескольких) , порт при этом может быть любым.
PS В SMTP есть два механизма передачи по зашифрованному каналу:
- По установленному заранее соединению SSL (обычно называется "SMTP over SSL" или SMTPS, обычно используется порт 465)
- Переходом от незашифрованного соединения к зашифрованному по команде SMTP STARTTLS ("SMTP Service Extension for Secure SMTP over TLS", используются те же порты (587 - клиентское подключение, 25 - сервер-сервер)
Клиенты (MS Outlook, к примеру) для использования этих разных механизмов требуют разных настроек.
И сервер и клиенты SMTP вполне могут не поддерживать один из этих механизмов (например, потому что SMTPS какое-то время считался устаревшим).
