Сам битбакет тоже непуст, верно? Репозиторий залился успешно?
Вообще проект клонируется? Например, из консоли git clone ...
?
А если checkout без плагина, просто опция Git?
Короче, хочется понять в чем проблема, настроек битбакета, плагина, ide или что-то еще..