efkot

скрутите всё в бекап
поднимите в домене SQL пропишите тот же алиас, разверните бекап, профит.

мелкомягкие не приветствуют MSSQL на контролере домена. будете ставить MySQL?

производитель HDD?
win 2008 и win 7 имеют проблемы с винтами более 2ТБ, используйте софт от производителя, правда он может не взлететь на 2008

файрвол на конечных машинах, в каком статусе??