Может быть, я устарел и webpack стал универсальным средством, но поначалу его использавали для desktop-ных задач, например, совместно с electron, который многим не подходил или был просто неудобен из-за большого количества мелких файлов в node_modules. А уже после, вроде даже совсем недавно, весь bower ставли перетаскивать на npm.
