AnGel

Избавиться от него в пользу php-fpm.
Поставить реверс прокси и отфильтровать на нем отбросив весь мусор.
Банально настроить его выставив кол-во запущенных процессов и кол-во клиентов.
Пишите в телеграм, могу проксировать вас, если атака сильная.

Это выставляется в зависимости от сайта.
Наймите админа, ибо на разные страницы сайта нужны разные лимиты. Это не делается все под одну гребенку.

Переразметь и начни с начала

FastCGI + Memcached + Opcache