dollar

window.scrollTo(999999, 0);

А приложение вообще работает? alert(123) выводит?

Если да, то, скорее всего, просто нельзя менять локацию. Попробуйте ajax к www.ok.ru, а контент формируйте динамически тем скриптом, который является частью приложения - это будет как бы ядро вашего приложения, в котором будет вся логика загрузки контента и его отображения.

В общем случае удалить скрипт нельзя.

Иногда возможен костыль. Для глобальных функций можно их переопределить, заменив другими. И вообще многие глобальные переменные можно удалить. Обработчики можно удалить все, если есть доступ к обработчику, то есть ссылка на функцию не спрятана где-нибудь в замыкании или какой-то локальной области видимости.

Но если, к примеру, весь код банально обёрнут в анонимную функцию, то он практически невидимый извне. С ним ничего нельзя сделать. Можно только при следующей загрузке страницы не загружать этот скрипт. И обычно много всего спрятано именно так, в замыканиях, в стеке.

Думаю, можно сделать легко. Как-то так:
1) Делаем страницу без скролла, которая умещается в экран.
2) На странице несколько дивов с размерами 100%, которые накладываются друг на друга, то есть это как бы слои. И вот эти дивы уже со скроллом.
3) Верхний див сделать невидимым. В нём с некоторой периодичностью, а также по событию проверяется текущая позиция скролла и используется в вычислениях.
4) Нижний див, соответственно, принимает это значение и программно меняет позицию своего скролла в обратном направлении.

Проблема только в обычном взаимодействии со страницей. Я не уверен, как можно ловить только скролл верхним дивом, а всё остальное (клики, тапы) пропускать. Можно легко сделать, чтобы вся мышь или тач были прокинуты к нижнему диву, но тогда схема теряет смысл. В общем, думаю, можно как-то ловить клик, считать его координаты и передавать ниже.

В PHP достоверно проверить действительный адрес нельзя. Но достаточно надёжно можно проверять $_SERVER['HTTP_REFERER']. Если он ссылается на страницу1, то всё ок, а если нет, то скорее всего страница2 открывается в браузере напрямую.

В JS нет смысла делать что-либо в "проверку на js" (я так понимаю, вы про noscript), потому что в этом случае js не работает вообще. Поэтому делайте в инлайн js скрипте так:
1) Если JS работает И если это фрейм, то подгрузить js файл.
Если inline скрипт не сработал, то в noscript можно просто попросить включить JS, и по умолчанию js файл грузиться не будет (в этом просто нет смысла, как я уже сказал).

Нужно создать глобальную переменную, в которой хранить число активных чекбоксов.

• Если чекбокс активирован, то активируется кнопка, и переменная увеличивается на +1.
  
• Если чекбокс деактивирован, то переменная уменьшается на 1, и если она стала равна 0, то кнопка деактивируется.
  

function enoughTime() { // Возвращает true, если прошло больше 2 секунд
  let now = (new Date()).getTime();
  if (!enoughTime.save) enoughTime.save = now/2;
  if (now - enoughTime.save < 2000) return false;
  enoughTime.save = now;
  return true;
}

Потому что timerId у тебя локальный. Он виден только внутри функции, и не сохраняется по завершению функции. Так что где бы ты его ни использовал, timerId будет не определён. Объявляй его вне функции или запоминай в чём-то, что существует дольше.

Я делаю все вопросы в отдельной структуре.

А на экране показываю одновременно только один вопрос и кнопку "Дальше". То есть DOM формируется динамически. Причем, при показе вопроса варианты ответов перемешиваются (кроме вариантов "ничего из вышеперечисленного" и "всё вышеперечисленное", которые добавляются в конец).

Собственно, порядок вопросов тоже можно перемешать. Но здесь уже начинаются тонкости. Потому что некоторые вопросы стоит показывать в определенном порядке. А некоторые вопросы не стоит показывать вообще, если был дан неправильный ответ на определенный предыдущий вопрос. Не знаю, стоит ли вам заморачиваться так, как я.

К слову, тест знаний делать на js - так себе идея. Ведь шпаргалка открывается в два клика (или комбинацией Ctrl+U) и читается без навыков программирования. По уму вопросы и ответы должны перемешиваться на сервере, id ответов должны быть каждый раз произвольные типа fGx9PeL7, подсказки ответа в js коде не должно быть вообще (проверка ответа только на сервере), вопросы должны отдаваться не все сразу, а порциями через ajax, ну и на каждый вопрос должно отводиться ограниченное время. А если лимита времени нет, то придется физически стоять над душой респондента и смотреть, чтобы он не лез в Гугл за подсказками. Ведь тест знаний должен проверять знания в предметной области, а не хакерские способности или скорость гугления.

Примерно так:

Но можно и самому легко. Там всё очевидно, как работает. Просто учти, что в JS символы условно двухбайтовые, то есть код символа где-то примерно от 0 до 65535.

function makeDOM(html) { //Формируем DOM на основе структуры
	for(let category in html) {
		let det = document.createElement('details');
		let cat = document.createElement('summary');
		cat.innerText = category;
		det.appendChild(cat);
		html[category].forEach(o=>{
			let button = document.createElement('button');
			button.className = o.k;
			button.innerText = o.id;
			det.appendChild(button);
		});
		document.body.appendChild(det);
	}
}

let html = {};
function makeButton(o) { //Формируем структуру
	if (typeof o !== "object") return;
	if (o instanceof Array) {
		let k = o[o.length-1];
		o.forEach(e=>{e.k=k,makeButton(e)});
		return;
	}
	if (!o.id) {
		for(let k in o) makeButton(o[k].concat([k]));
		return;
	}
	let summary;summary = html[o.category] ||(summary = html[o.category] = []);
	summary.push({k:o.k,id:o.id});
}

window.addEventListener('DOMContentLoaded',e=>{
	makeButton({A:A,B:B,C:C,D:D});
	makeDOM(html);
});

Да, возможно.

Посмотрите в Википедии. Ну и Гугл тоже может помочь, как бы это оскорбительно и занудно ни звучало.

Но вы не торопитесь юзать новые фичи. Не все оперативно обновляют свои браузеры. Так что ES2016 лучше начинать юзать в 2021, ES2017 - в 2022 и т.д. В этом плане ES2015 исключение, слишком крутой скачок, а дальше хоть трава не расти.