Использую msysgit 1.6.5.1 (на другой машине пользовал более раннюю версию, не помню цифры). Складывается такое чувство, что с каждой новой версией все хуже и хуже :)
TortoiseGit не пользовал, достаточно было Git Bash'а. Главная проблема — не работает протокол git://, приходится все через http:// делать (может, руки.sys подводят?), с кодировками и прочим вроде проблем не было.