Стоял ли какой-нибудь сторонний дополнительный софт для создания и проверки резервных копий на предыдущей ОС?
Выйдите из системы и затем войдите в систему снова. Попробуйте извлечь диск еще раз. Если диск будет успешно извлечен, то это только говорит о том, что все-таки он используется какой-либо программой.
Была подобная проблема. Софт отвечал за отображение лога с подробными данными о созданных резервных копиях. После его удаления с помощью AppZapper (не обязательно использовать его) проблема решилась.
Багов может быть предостаточно, но эта проблема одна из популярных. В ином случае нужно обращаться к внешнему устройству через терминал и уже там искать причины такого оповещения.