В
ShoeBox есть функция "extract sprites", которая одну большую картинку с прозрачным фоном нарезает на кучу мелких. Может подойдет. Там еще для вас может оказаться полезной возможность разрезать psd файл: слои в png картинки. Ну и в целом хорошая штука, работает на Adobe Air.