Вы использовали juaJIT`овский декомпилятор, он очень плох. Для декомпилирования лучше использовать питоновский, там код намного лучше.
Скрипт после декомпиляции идёт в нерабочем состоянии. Если вы хотите что-то изменить и игра "съела" скрипт - нужно полностью переписывать нерабочий код.

А если после переписывания вы хотите "спрятать" код - используйте обычный juajit`овский компилятор. Если прям "спрятать спрятать" - обфускация и протекторы в помощь