В checkBoxes находится id, следовательно выбрать элемент по уникальному id можно так - $('#' + checkBoxes).
Видимо find(checkBoxes).prop("checked", !checkBoxes.prop("checked")); надо заменить на
$('#' + checkBoxes).prop("checked", !$('#' + checkBoxes).prop("checked"));
или как-то так.