На что обратить особое внимание в при изучении php после javascript?

По твоему -- на PHP кодят те, кто не способен изучить "нормальный язык"?
На PHP, предже всего, кодят по той причине, что 95% заказов на рынке выб-разработок это именно PHP. Смысл учить "нормальный язык" и курить без дела в стороне?

Yii2. Замыкание. Как получить id добавленого поля?

Правильнее, конечно, явно возвращать вставленный ID нужной модели (как у вас сейчас это сделано), иначе могут быть проблемы. Например, если в дальнейшем добавите метод Company::afterSave() в котором будет сохраняться что-то ещё или если кто-то успеет вставить новые данные в БД в тот момент, когда вы будете получать lastInserID (как вы и сказали)