PHP в Linux присутствует в 4 основных ипостасях:
1. консольное приложение php
2. модуль для Apache
3. FPM модуль для nginx и т.п.
4. библиотека php-mysql
Все они могут быть разных версий, связанных или не связанных между собой.
php -v - это консоль. веб-сервер может быть настроен на использование другой версии пыха.
для веб-сервера нужно смотреть выхлоп phpinfo().
как лечить на панелях понятия не имею.
и, как уже написали, лучше вообще не пользовать PMA.
