Рекомендуется HDD оставить на месте, т.к. там стоит датчик падения и отключает HDD. SSD ставьте вместо CD, на скорость чтения не повлияет. Установку новой Mac OS можно запустить прямо с рабочей системы, скачать её можно из AppStore, при установке выберите необходимый раздел