Это старая проблема, обчно лечится добавлением на -webkit-backface-visibility: hidden; на элемент body, встречается во многих цсс ластиках. Почему помогает, затрудняюсь ответить. Если 3D transform к body применять не планируете, то в принципе бояться нечего. А вообще со свойсвом backface-visibility лучше обращаться аккуратно и не навешивать на разные элементы, на старых андройдах могут повылазить очень веселые баги с морганием в самых неожиданных местах.