согласен с опубликованными ответами в части "Перенастроить"
при наличии доступа только к ssh (надеюсь, админского) относительно просто будет попробовать
rear - relax and recover
Бэкап на шелл-скриптах и базовых утилитах. При переносе могут быть проблемы только с зеркалами на btrfs и, может, udev, если основа виртуалки "другой системы"