Недостаточно информации для ответа на вопрос. Если под файлами в папках подразумеваются скрипты и стили, то в functions при их подключении используйте get_stylesheet_directory_uri вместо get_template_directory_urri.
если под файлами подразумеваются файлы локализации, то в functions нужно добавить строку с textdomain для дочерней темы.
Если под файлами подразумеваются рнр файлы, то попробуйте щагрузить их в корень дочерней темы, а не в субдиректорию. должно помочь.