gparted, уменьшаете/передвигаете разделы так, чтобы он занимали от начала диска меньше, чем объём нового винта.
В клонзилле выбираете режим эксперта, перенос диск-диск, ставите опцию игнорировать размер нового диска.
Всё, что было на новом диске клонзилла сотрёт.
После переноса снова gparted и раздвигаете разделы как вам нужно.