Никогда не поздно, возможные исключения за тобой.
<?php
$x1 = 10;
$y1 = 10;
$x2 = 5;
$y2 = 5;
$alpha = rad2deg(atan2($y1 > $y2 ? $y1 - $y2 : ($y1 == $y2 ? $y1 : $y2 - $y1), $x1 > $x2 ? $x1 - $x2 : ($x1 == $x2 ? $x1 : $x2 - $x1)));
echo($alpha)
?>
UPD: В этом решении можно получить угол, если координаты по отдаленности будут меняться между собой, решение будет правильным.
UPD2: Пример, если это по-типу радара и углы 0 - 180 и 0 - -180:
$alpha = (($y1 > $y2 ? 180 : -180) - rad2deg(atan2($y1 - $y2, $x1 - $x2))) * -1;
