Ответ распадается на 2 части.
1. Если Вы понимаете, что у разбежались состояния ветки, но просто хотите, чтобы не всплывал редактор для внесения комментария к mergе'у, то ответ был выше про git_merge_autoedit. То есть добавьте в окружение переменную GIT_MERGE_AUTOEDIT=no. На другом сервере "такого" нет, потому что, видимо, там в окружении уже присутствует GIT_MERGE_AUTOEDIT=no.
2. Если Вы пытаетесь понять природу необходимости merge'а, во время выполнения pull'а, то она состоит в том, что пока Вы что-то делали локально, кто-то успел внести свои изменения в данную ветку. Есть два основных пути - либо использование stash перед commit'ом, либо rebase после commit'ов.