Сперва нужно узнать какой FTP сервер установлен. Варианты:
1. netstat'ом посмотреть кто слушает 21 порт:
netstat -lt | grep 21
или
netstat -lt | grep ftp
2. Посмотреть кто ответит на telnet:
telnet localhost 21
Скрипты запуска и остановки находятся в /etc/init.d. Допустим, FTP сервер у нас vsftpd, скрипт запуска называется vsftpd, тогда команда для перезапуска будет выглядеть следующим образом:
/etc/init.d/vsftpd restart
или
service vsftpd restart